实行校务委员制度。蒋介石、胡汉民、戴季陶、吴稚晖、阎锡山、冯玉祥、李宗仁、李济深、何应钦、张学良、朱培德为首批校务委员。其中蒋介石、阎锡山、何应钦为常务委员。张治中担任军校教育长并且主持工作。黄埔军校从此开始了南京中央军校时期。
1928年5月15日，军校的名称一度改为“国民革命军军官学校”；1929年9月10日，又改名为“国民革命军黄埔军官学校”。黄埔6期和黄埔7期的学生分南京、黄埔两地授学。军校南京部分的学员第6期1929年2月24日共3634人毕业：第7期学员于1929年12月28日共852人毕业：军校黄埔部分第6期学员1929年2月24日共718人毕业；第7期学员666人于1930年9月26日毕业。在黄埔7期学生中还包括朝鲜籍学生34人，越南籍学生13人：朝鲜人民军著名领导人崔庸健(在军校时化名崔石泉)等就曾在黄埔6期和黄埔7期执教过。自从大革命失败以后，由于黄埔军校清党、新军阀战争以及广州起义等事件的影响，军校黄埔部分的学生已经人大减少，所以此时它实际上是南京中央军校的预科学校。1930年9月在军校第7期学员即将毕业之际，蒋介石电令广州“第7期毕业后黄埔校停办”，短短十个字就使驰名中外的黄埔军校停办了!
从第8期学员开始，军校对教学方式、修业期限以及课程设置都进行了重大改革。首先军校学制改为三年，第一年为入伍生教育，第二年和第三年为理论教育年：学生所学的科目包括术科和学科两大类，术科包括单兵教练、班教练、排教练、工兵勤务、射击、武术体操等；学科除了陆军礼节、步兵操典、步兵射击、野战筑城、通信、卫生学、战术学、地形学、兵器学、瓦斯学、炮兵学、战车学、航空学之外，还设置了三民主义、外交史、中国革命史、外国革命史、中国政治经济概况、法学、人生哲学、数学、物理、化学以及英语、德语、法语、日语等课程，学生的知识面更加广泛了。第8期学员1930年开学时的时间不
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