占领区开展广泛的游击战，对打击日寇和汉奸，起了不小的作用。国民党两大特务组织之一"军统"成立1938年8月，国民政府军事委员会调查统计局成立，简称"军统"它是国民党两个主要特务组织之一。其前身是复兴社的核心组织"力行社"的特务处。军统局内勤组织共有八处、六室、一所;外勤组织在各大城市设"区"在各省设"站"，在一些重要城市设特别组，它甚至连边远如伊犁、拉萨及一些国外的重要城市都设有机构。"军统"的基本组织是"组"及直属情报员，它们的特工人员分布到国民党的军队、警察、行政机关以及交通运输等各个部门。它控制了一些大专院校的"抗日锄奸团"、海关、边卡和交通要道的"缉私大队"、"税警大队"、"盐警大队"、铁路沿线的"交通大队"，以及江南各沦陷区的"忠义救国军"等公开武装部队。军统利用监视、绑架、逮捕和暗杀等手段，进行特务活动。抗战期间，军统局的正式在册人员和学员，在抗日战争中牺牲者就达18000人以上，而抗战结束时全部注册人员为4万5千余。其他附属人员牺牲者更众。
同时，军统对GCD进行收集情报和暗杀，如1940年8月13日，中国GCD陈昭礼少将（全国战地动员委员会委员）在崇安吴公岭被事先埋伏的务军统杀害。也有一些军统人员投降日本，日本占领区的重要特务头子大多来自军统中统，如李士群、丁默村等。
组织形式
军统局的组织形式是局-区-站-组-队，有的地方设有相当区、站的办事处。组是军统局特工组织的基本单位。由于任务不同，组又分普通组、潜伏组、行动组、策反组、随军组、防谍组、组等。每组通常由十人左右组成。
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