不过这两种同样产自美洲的高产作物，在推广时却遇到了一些问题，其中玉米还好，虽然玉米的产量不及土豆，但它和小麦、水稻一样，都是地上作物，而且出产的种子晒干后，可以长时间保存，与传统的粮食作物区别不大。
但土豆就不一样了，土豆是块根植物，可食用的也是块根，而且块根的保存也比种子麻烦，需要专门的地窖存放，而且存放时间也有限，如果再加上低温条件，有些地窖甚至能存放土豆一年都不坏。
当然绝大部分土豆都存放不了那么长时间，一般来说，土豆存放几个月不坏，就已经十分难得了，如果存放的条件不好，或是土豆本身有伤口，那存放的时间就更短了，而且土豆万一发芽，也没办法再食用。
可以说相比传统的粮食作物，土豆其实是有很大的局限性的，当然也可以把土豆蒸熟后切片，晒成土豆干保存，或者更进一步，做成粉条，都可以长期保存，只是这就多了一道工序，增加了土豆存放的成本。
另外土豆做为地下作物，与传统的小麦与水稻都不同，所以普通的农户对土豆这种新作物也有些怀疑，特别是官府宣扬的土豆产量更是太过惊人，听起来更像是假的，而且越有经验的农人越是怀疑。
所以综合上面的考虑，土豆的推广种植并不怎么顺利，反倒是产量比土豆低许多的玉米，却十分受农人的欢迎，因为玉米不但产量比小麦、水稻高，而且耐旱耐贫瘠，玉米杆还是十分优良的饲料，家里的牛羊都很喜欢吃，所以玉米简直全身都是宝，许多人宁愿少种几亩小麦，也要种上玉米。