连年征战，实际上宰相并不掌握实际的权力，由此三省几乎形同虚设。各地争权的政事多由皇帝特派使臣办理，成为宋代以差遣为正官的开始。
到了宋代，虽然三省名义始终存在，但是实际上已经混同为一省。同时由于枢密院、三司的设立，宰相的军权、财权被剥夺，至此三省制度名存实亡。
及至元代以中书省总领百官，与枢密院、御史台分掌政、军、监察三权，尚书省时置时废，而门下省则不复置，故中书省较前代尤为重要。
到了明初，朝廷则不设中书令，仍以中书省统六部，六部的长官称左右丞相。明太祖洪武十三年，诛胡惟庸，废丞相，撤销中书省，六部开始直接对皇帝负责。
至此，三省六部制的三省彻底废止！
这些情况都是此时耿寿昌和门下令萧望之都是无法觉醒的，可是天子刘洵有着后世两千年的历史经验，完全可以推动这一历史进程，将后世千年时间逐渐演变成的结果，在数年、乃至十几年的时间里，亲手打造成一部高效运转的治国机器！
耿寿昌看了看门下令萧望之，说道：“既然天家有意让我出任上计部尚书，那老夫定然全力以赴，为天家分忧。只是老夫还是有些担心，一旦天家开始虚三省，那门下令如何自处？”
门下令萧望之大笑了起来，说道：“关于这个事情，我倒不是很担心，天家自然会给我一个好的去处。另外……”
“呵呵，门下令有话便请直说。”
门下令萧望之说道：“我听到风声，天家准备在需三省之后，三省下设的各部连同少府全部直接对天家负责，由天家直管各部！如此一来，天家的权柄之重，已经超过当年孝武皇帝，乃至是前秦始皇帝了！”
“至于我的去处……，我听闻届时天家准备成立一个新的部门，专门由像我这样的人组成，作为天家的智囊，并且辅助天家处理朝政！”
耿寿昌微微皱眉，而后像是想明白了，说道：“也就是说，天家会在自己与各部
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