最后时刻，已经被改造了的埃米尔遇到了变成“怪物”的姐姐，姐姐哈鲁亚能轻松撕碎埃米尔，但她下不去手，任由埃米尔用不受控制的石化魔力，将自己变成了石头。
之后，埃米尔失去了记忆。
《尼尔》一代的故事开始。
中间的故事省略。
埃米尔找到了被自己变成石头的姐姐，为了拯救现在的朋友，他直面姐姐，继承了姐姐的魔力，外型也变成了姐姐怪物的样貌。
也就是圆脑袋，圆眼睛，嗞着门牙，咧着大嘴诡异微笑的埃米尔。
再之后，埃米尔在一次事故中选择牺牲自己，自爆。
但他的身体过于强大，那一次自爆并没有让自己死亡。
埃米尔在《尼尔》一代的故事，就此完结。
因为魔法自爆，只剩下一颗脑袋的埃米尔坠落到沙漠里，于是，他开始滚动自己，一路强化自己，制造新的身体，一路寻找过去的伙伴。
“等我恢复了，就找你们去。”
埃米尔当时对自己这么说。
他还想回到伙伴身边。
但是……
那之后他就只剩自己一个人了。
八十天，环游了地球。
期间收集了大量的武器和货物，那些货物被储藏在世界各地，成为了《尼尔机械纪元》里著名的“车神”埃米尔的货物来源，它也是这世界唯一一个不需要雅科尔去供货补给的售货商，虽然从来没卖出过东西就对了。
扯远。
回来。
公元纪元5012年，外星人入侵地球。
这时候，地球上的机械工程已经停滞，人类创造的机械人（人造人）数量越来越少，部分人造人成为了“独立者”，内部爆发矛盾。
保护地球的重任交在了唯一的人类，埃米尔的身上。
埃米尔创造了8000万个分身，抵御外星人和机械生命体，但也因此，埃米尔的记
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