父亲皇太极
母亲孝庄文皇后
妻子：废后，静妃，博尔济吉特氏，是孝庄皇太后的哥哥科尔沁卓礼克图亲王吴克善的女儿，和顺治皇帝是姑表兄妹。顺治八年八月册为皇后，因两人性格不合《清史稿》中记载“上好简朴，后则嗜奢侈，又妒。”顺治十年被废。
孝惠章皇后，博尔济吉特氏，科尔沁贝勒绰尔济的女儿，是孝庄皇太后的侄孙女，也是顺治皇帝侄女，顺治十一年五月，聘为妃，六月，册为后。康熙皇帝即位后，尊为皇太后，居慈仁宫。康熙五十六年十二月薨，年七十七。
孝康章皇后，佟佳氏，满镶黄旗人，都统佟图赖女，生于崇德五年，是康熙皇帝的生母，康熙即位后尊为慈和皇太后，康熙二年二月崩，年二十四。
孝献皇后，董鄂氏，满正白旗人，内大臣鄂硕女，生于崇德四年，十八岁入宫，入宫后即宠冠后宫，顺治十三年八月二十五，立为贤妃，九月，进皇贵妃（十二月行册封礼）。顺治十四年十月初七，生皇四子荣亲王；顺治十七年八月，薨。顺治十七年八月二十一，追赠孝献端敬皇后。
贞妃，董鄂氏，一等阿达哈哈番巴度的女儿，孝献皇后族妹。顺治皇帝崩后，她即随之殉葬。康熙帝追封为皇考贞妃。
淑惠妃，博尔济吉特氏，孝惠章皇后的妹妹。顺治十一年，册为妃。康熙十二年，尊封为皇考淑惠妃，康熙五十二年十月三十薨。
恭靖妃，浩齐特博尔济吉特氏，多罗额尔德尼郡王博罗特女。康熙十二年十二月初四，尊为皇考恭靖妃；康熙二十八年四月初三，薨。
端顺妃，阿巴亥博尔济吉特氏，一等台吉布达希布女。康熙十二年十二月初四，尊为皇考端顺妃；康熙四十八年六月二十六，薨。
宁悫妃，董鄂氏，长史喀济海女。顺治十年七月十七，生皇二子福全；康熙十二年十二月初四，尊为皇考宁悫妃；康熙三十三年六月二十一，薨。
恪妃，石氏。是吏部侍郎石申的女儿。康熙六年薨，是宫里正妃中唯一汉人妃子。
此外，顺治皇帝有子女的庶
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