人认为达文西是为了保守秘密，但比较合理的看法则是镜像反写才合乎左撇子书写的天性。
达文西记录了他的素描、发明、建筑设计、力学元素、绘画构想、人体解剖、物品清单甚至向他借钱的人。
这些不同形式大小的手稿原先在他辞世后散布在朋友手中，现在主要收藏在罗浮宫、西班牙国立图书馆、米兰的安波罗修图书馆以及伦敦的维多利亚和阿尔伯特博物馆及大英图书馆。
大英博物馆将达文西的手稿精选上网，放在turning the pages的分页中。达文西手中主要的科学纪录─莱斯特抄本则为比尔、盖茨所拥有，目前每年在全世界不同的城市展览。
对那些认为达文西想要将他的观察普及为大众知识的人来说，为何达文西不出版或以不同的方式散布手稿内容，至今仍是一个谜。
科技历史学家路易斯姆福特认为达文西将手稿有如个人游记般保存，那麽想将这些成果用於不当之处的人将无所查阅（比方坦克车）。
直到19世纪，这些手稿都一直处於隐匿状态，但对那时的科技发展而言，已无直接助益。
2005年，研究人员发现所谓的达文西秘密实验室，这个实验室用来作飞行及其他先进科技研究，发现的位置在佛罗伦斯市中心的古罗马圣地西玛安纽立亚他大教堂，隔壁修道院的一间事先封闭的房间。
私下，达文西始终保持秘密。并宣称其厌恶**关系，曾说与生儿育女有关的任何事令人厌恶，人若没有美好面孔以及美感素质将会早亡。根据后来佛洛依德分析艺术家时的解释，达文西是性冷感者。
..在维多利亚女皇的收藏中，有一件1518年所作的**画作《印加魅地天使》，后面也有沙莱的名字。
达文西依据沙莱的外观所绘的主要作品《施洗者圣约翰》看起来有趣诙谐且袒胸露肩，评论家如马丁肯普及詹姆士沙士罗批评该画灌输同性恋思想。
虽然沙莱称之为达文西的学徒，他也声称达文西教了他很多绘画方面的东西，但和其他学徒相比，通常
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