南北的军队或被歼灭，或被包围，但他们并非没有还手之力，在真金手中还掌握着一支多达二十余万的军队——侍卫亲军。
侍卫亲军在元朝的军事系统中是一个特殊的存在，它是大汗亲手掌握和控制的最为重要的一支武装力量，是蒙古统治者进入中原后仿照中原王朝设立的不同于草原传统怯薛军的中央卫军组织，其地位相当于宋朝的御前护军，前朝的御林军。
侍卫亲军在忽必烈时代是平定诸王叛乱中发挥了不可替代的作用，尤其是在制衡汉军万户和有效控制朝政方面是其有力的军事砝码。作为中央禁军的一支，它又体现出完全与怯薛不同的特点，同怯薛的关系实际上也是元代统治者民族二重性表现的缩影。
怯薛和侍卫亲军虽然都是中央禁卫军，但是在职能上有明确分工。侍卫亲军士兵的成分与待遇和普通士兵并无不同，其主要功能在于平衡地方武力，而不像怯薛那样兼有多种政治功能。怯薛负责皇帝的安全，掌管宫城和幹耳朵的防卫，一般不外出作战。侍卫亲军则既要负责两个都城的安全计腹里地区的屯守，又是朝廷用以‘居重驭轻’的常备精锐部队，随时可以出去作战。
作为皇权的干城，在隶属关系上也和怯薛之间听命于皇帝不同，侍卫亲军由各卫都指挥使司掌管，除东宫、后宫卫军外，均隶属于枢密院。其功能大致有以下几项第一，作为常备军，防守两都及附近地区。第二，作为控御地方的中央武力，逢有反叛，出征讨伐。第三，非军事时期，屯田自给军食，减轻国家负担。第四，承任两都营建、修缮等劳役。
所以其一方面由于它的机要性，使它在君主统治中占有重要地位，能否有效的控制禁卫军军权以及以何种方式进行控制，是衡量君权强弱兴衰的一个重要标准。另一方面，由于侍卫亲军是京畿地区的主要武力，地近宫阙，成为元廷的安全屏障。随着元朝统治者对中原汉地统制和开发，在怯薛的军事功能逐渐蜕化的情况下，侍卫亲军成为元军的中坚力量，已经逐步取代了怯薛作为全军‘大中军’的军事地位。
根据各方面的情
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