但是进入基地中后爱丽丝才发现，原来在这一座基地中，艾萨克斯博士一直利用自己的克隆体来进行试验。而现在，艾萨克斯博士已经感染了新的病毒，并且将自己转化为一个怪物，而基地中的保护伞公司职员已经被艾萨克斯全部杀死。
基地的智能系统白后将艾萨克斯封锁，爱丽丝进入封锁区域和去追杀艾萨克斯博士，一番激战后，最终在激光通道将艾萨克斯杀死。
那之后，爱丽丝决定开始对保护伞公司的全面报复，她利用研究基地中的克隆设备，开始大量的克隆自己，制造出了一支强大的武装力量！
在电影的开头，爱丽丝成功找到了保护伞公司位于东京的总部，并开始了一场全面的入侵。
而叶千狐的目标，威斯克，现在正是保护伞公司东京总部的主管。[醉书楼小说网/\/%^www.\zslxsw.\\com]
不过，在原剧情中，这场战斗在叶千狐看来其实算不上成功。这一次的战斗中，她虽然毁灭了东京的保护伞公司基地，但是威斯克却成功的逃走，并且为爱丽丝注射解药让她失去了能力，而爱丽丝的那些克隆体也全部战死。
叶千狐拿出手机，打开摄像头朝向周围的街道，然后对手机说道：“红后，对比地图，找出来我现在的位置。”
“好的，主人，正在辨认中。”
在这样的一个背景中，红后的能力被最大幅的的削弱。红后这样的智能系统，她很强大的一个能力就是入侵网络系统，并借此给叶千狐提供各种便利，但是现在，人类都要灭亡了，还说什么网络系统。
叶千狐从一开始就有了让红后玩单机的觉悟，顺便在手机里让红后下载了一大堆地图进去，至少现在红后可以凭借地图给他当个导航。
叶千狐的手机上很快现实出一张清晰的地图，他的位置被一个蓝色的光点所标注，而在地图的另一个位置，是一个明显的红色光点。
“已确定你现在的位置，和保护伞公司东京总部，直线距离153公里。”
得到红后的提醒，叶千狐赶紧下楼，至于
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