，感染了包括母体与锡安在内的所有虚拟世界的程序，将自身复制到每一个程序对象与人类虚拟体上，令虚拟秩序全崩盘——虽然这些地方都在机械大帝专门画出来的隔离圈子里。
虽然此时的尼奥已经知晓了大部分的真相，但在名为“爱”的程序引导下，为了拯救人类与自己的爱人崔妮蒂，他只能选择将自我所有程式公开，让机械大帝侵入获取他当前的程序本源——那如同人类一般，充满了情感，遍布着矛盾，既混沌又明确的神奇核心算法。
机械大帝就在这尼奥与史密斯的数据纠缠中，取得了最终进化的钥匙。
在母体模拟的二十世纪城市里，史密斯与尼奥的最终决战打的天翻地覆，但对于程斌与机械大帝来说，那不过是某些表层数据的交互罢了，结果在收获了果实后就已经注定，拥有底层权限的机械大帝随时可以将整个虚拟世界重置。
人类被史密斯覆盖的只是虚拟世界里的数据体，本身并没有受到什么的影响，对于能够操纵记忆的智能程序来说，想让人类在毫无知觉的情况下恢复平静的日常生活真是不要太简单——
操纵记忆，真的是件非常可怕的事情，生活在虚拟世界中的人类，永远不会知道自己的生活是不是刚刚才被创造出来的，不知道自己那些刻骨铭心的记忆与文明引以为傲的历史其实并非真实存在，而是由数据转化而来。
随着虚拟世界被机械大帝重置，人类在无知无觉间就回归了平静的日常，一切都结束了。
在剔除了不需要部分的感性算法后，机械大帝所有的分支程序都载入了这来自尼奥的进化之钥。
月球战舰的最终调试，在进化的智能程序面前很快就完成了。
黑暗漫长的星际旅行，对于没有多余负面情绪的智能程序来说完全不是障碍，而物质与能源的制约——
质量比铁轻的元素会在聚变中释放能量，质量比铁重的元素会在裂变中释放能量。
对于掌握了高级裂变与聚变技术的智能程序来说，任何非铁物质都是可以利用的能源，而有了能量它们又可以将任何
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