人就能征服的印第安部落了。西班牙王国用了三年的时间证明，他们根本无力把殖民地恢复到以前的状态，也就只能选择妥协。
最终，西班牙政府承认了，克里奥尔人这种出生在殖民地的白人和梅斯蒂索这类白人与土著混血的利益，把他们已经获得的利益补上国王的授权，然后联合这群人对付印第安部落和少量黑奴的抵抗。
当时的帝国也寻求美洲的稳定，因为只有稳定才能带来商业的扩张。于是帝国军方停止了对抵抗者的支持和援助。
只用了两年时间，秘鲁总督区的剩余部分重归了西班牙人的统治，只有少量印第安部落逃亡高山和雨林，进行着抵抗斗争。
但是，殖民地乡绅的利益得到了极大的承认，在利马，他们建立了一个议会，这个议会只要三分之二的人投票反对，那么总督的政策就不能施行，而本土派来的大贵族最多担任都督和重要城市的市长职位，大片地域的官员任免由殖民地人接替去了。
秘鲁总督区还进行了税收、贸易等改革，使得其可以自由的与中国进行贸易，不受本土的控制。
西班牙得到的仅仅是一部分统治权和每年都有增长的税收。
用西印地院某位官员的话来说，国王失去了尊严，得到的却是金币。
在这几年，新西班牙总督区和西印度群岛地区也有效仿秘鲁总督区的趋势，只不过被西班牙本土严厉的镇压了下去，但殖民地乡绅在地方上扩张政治和经济利益已经是西班牙管制不了的事实。
原本秘鲁总督区就对西班牙充斥着不信任，双方对立情绪严重，现在忽然出现了国王要收回土地的谣言，这股子风潮就再也压制不住了。而抵达了利马的安东尼奥高呼保护秘鲁总督区利益的口号，立刻就得到了秘鲁总督区议会的支持。
那些乡绅坚定的站在了安东尼奥身边，与秘鲁总督针锋相对，当秘鲁总督要暗杀安东尼奥的时候，议会毫不犹豫的废黜了总督，收缴了本土驻军的武器，把军队和总督软禁起来，要
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