后的唤醒章节是李杰添加的，把瑞贝卡的案例改写了进去）。
很快，一项“唤醒”计划，提上了日程。
唤醒计划：活捉感染者，利用孤山岛的克隆技术和精神传输技术，逆向“变异”恢复到之前的样子。
该计划投票表决，最终以压倒性优势，通过了决议。
因为联邦体系中，有很多军人在历次战斗中，都被感染了病毒，他们成为了亚人或者是半亚人。本来政府就头疼该怎么处理他们，再加上他们也有亲朋好友、家人爱人，正巧昌灿的日记，就非常适时的出现了。
“唤醒”计划由联邦元首李杰总牵头，联邦副元首阿列克谢和唐纳德辅佐，联邦总司令：瓦连京，科技协会会长：天风锐，星辰学院院长：沈同，医疗协会会长：瑞秋，商人协会会长：奥里奥丹，坂良市市长兼革命委员会代表：秋山光等人负责计划的具体实施。
首先由军队负责抓捕感染者，这项重任自然就落到了亚人和半亚人的肩上，而后转运到孤山岛，再由科研和医疗人员接收，最后进行克隆替换、意识“唤醒”的工作。
本来众人以为最困难的抓捕工作，却反而出奇的顺利，莱文市的感染者，竟然主动迎上电弧枪（用于活捉的电击枪），还不反抗和攻击。
任谁也没有想到，这是母体艾什的控制。不光是他，其它母体传播出去的感染者，也在各自母体（玛蒂尔达、拉扎罗夫）的控制下，就像是前来排队打针的病人一样，乖乖的被一个个的送入“唤醒”间。
嗡嗡…克隆工厂全天候开工，根据不同的DNA基因，克隆出一个个不同年龄、不同样貌的躯体。
但即便如此，产出也追不上供应，反而成了“唤醒”计划的压力位。
但这并不妨碍“唤醒”计划的实施，四大母体团结协作，明日大陆上的感染者在不到一年的时间，全部都被集中到了孤山岛基地。
联邦的亚人与半亚人（杰族）也完成了使命，成为最后一批被治愈的感染者
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