937年9月张建调任军医学校教育长，胡兰生接任署长。
会计处1937年10月设立军政部武昌办事处，1938年冬，又在桂林设立分处，均受会计长指挥：军事委员会计政室于1938年6月归并于会计处，定名为军政部会计处军事计政设计委员会，内分岁计、会计、审核、统计各组，每组设组长1人，办理关于规划、改进军事计政业务：会计长仍为陈良.
该部所属总务厅、马政司等人事、职掌仍旧：
三、军令部
1938年初，GMD国防最高会议常务委员会第四十三次会议决定，将原大本营所设第一部与GM政府参谋本部合并组成为军令部。该部于2月1日正式成立，直隶军事委员会，掌国防建设、地方绥靖及陆海空军之动员作战；后方勤务之筹划运用；情报及国际政情之搜集整理；参谋人员、陆军大学、测量总局及驻外武官之统辖与运用等事项：以徐永昌为部长，熊斌、杨杰为次长.军令部下设总务及第一、第二3个厅：第一厅掌关于国防作战事宜，辖4个处12个科；第二厅掌关于情报与派遣驻外武官及外国武官接待等事宜，辖4个处12个科及技术室、侦查电台；总务厅掌关于参谋人事教育及总务章则等事宜,辖3个处6个科。每厅设厅长、副厅长各1人。1938年3月28日任命刘斐为第一厅厅长，徐培根为第二厅厅长，陈焯为总务厅厅长。另外设有部属幕僚,由主任高级参谋、主任秘书及高级副官分别主管各有关业务，即高级参谋掌不属于各厅的机要及审核章则等事宜，部成立之后，任命张华甫为主任高级参谋，张元祜、刘云乾、杨宣诚等18人为特级高级参谋；主任秘书掌拟各种文牍及部分会报等事宜；高级副官掌接待中外来宾及传达重要命令等事宜.旋因人事、经费无着，仍于2月间先后呈准设将级高级参谋18人，校级参谋40人.6月该部呈奉核定顾问3人，附员80人.
根据军令部组织法，该部下辖工兵指挥部、炮兵指挥部、通讯兵指挥部、战史编纂委员会，通讯总所、技术室、各省测量局、
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