问是留有丈夫天武天皇回忆的地方，也是为了借用天武天皇的权威来提高自己威望。
后世其它的记录有持统天皇行幸伊势一次，行幸纪伊一次。据的记述，近江也有可能行幸了一次。伊势行幸，因为妨碍了农事，被中纳言三轮高市麻吕强谏。这次行幸意图是让地方豪族们继续协助藤原京的营造。
天武天皇生前为凡海氏皇后病愈而祈愿，开始兴建的大和国的药师寺在持统天皇时期完成，持统天皇定药师寺的寺格为勅愿寺。
在外交方面持统天皇继承天武天皇的政策，与新罗开展外交，与大唐没有官方的外交关系。
持统天皇不承认与新罗的对等关系，强迫新罗向日本朝贡。新罗因为当时与大唐对抗，所以不得以承认了这种不平等的关系，日本向新罗派遣了学问僧等留学生。
持统天皇统治期间，高市皇子是太政大臣。高市皇子尽管母亲的身份低微，但是在壬申之乱战功卓著，据推测在政务方面也积累了声望。高市皇子即使不是正式的皇太子，也是被众人拥护的皇位继承人的有力候补。
高市皇子在持统天皇十年去世。据的记载，这时关于持统天皇之后的继承人问题，持统天皇招集皇族、臣下商议，很多主张应该由天武天皇其他儿子继承皇位，但持统天皇意图让自己的孙子轻皇子继承，随着葛野王对众人一声大喝，出了结果，持统天皇十一年，正式册立轻皇子为皇太子。
持统天皇十一年，让位于15岁的轻皇子，即文武天皇。日本史上，持统天皇是在世的天皇中继皇极天皇之后第二个让位的，并且是第一个太上天皇
持统上皇让位后仍与文武天皇并座，处理政务。文武天皇时代最大的政绩是大宝律令的制定、施行，也被认为是持统上皇的意志。但是，代替壬申之乱功臣的藤原不比等这些倾倒于大唐文化年轻人才崛起，持统朝受到打压的刑部亲王复出政坛，所以也有学者认为文武朝有了变化，不完全是持统上皇的意志所主导。
文武天皇二年，
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