?来自TCGA的NSCLCRNA测序数据集,我们发现与相邻正常组织(ANT)相比,NSCLC组织中HLF的表达水平显著降低。通过分析来自TCGA的NSCLC数据集,与非复发的NSCLC组织3年内未复发,n=72)相比,HLF也是早期复发的NSCLC组织(一年内复发,n=72)中所有昼夜节律相关调节下调因子之一。
?我们之前基于AffymetrixU133Plus2.0芯片(AE-meta)结合TCGA分析的NSCLC整合数据谱的结果进一步表明,NSCLC组织中HLF的表达显著下调,并且在早期复发的NSCLC组织中进一步减少(补充图A,B)。
图片?Real-timePCR和Western印迹分析显示,与匹配的ANT相比,7/10对NSCLC组织中HLF的mRNA和蛋白水平降低(图1C和D)。
?Westernblot分析配对NSCLC组织中HLF蛋白水平与配对ANT的比较。α-微管蛋白作为负载控制。
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?1年复发NSCLC组织(n=5)与3年非复发NSCLC组织(n=5)的HLFmRNA表达和蛋白水平。转录水平归一化为GAPDH表达,P
?此外,与非复发NSCLC组织相比,早期复发NSCLC组织中HLF表达显著下调(图1E,F)。
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?不同亚型NSCLC及良性肺疾病组织中HLF免疫组化染色的典型图片(图A)。恶性NSCLC组织和良性肺组织中HLF不同免疫组化染色指数的病例数(良性肺组织,n=64;ADC,n=204;SQC,n=112;非小细胞肺癌其他亚型,n=26)(图B)。与TCGA(ANT)(ANT、=109、ADC、=511、SQC、=502)相比,ADC和SQC中HLF表达下调(图C)。来自TCGA和AE-meta的NSCLC数据集证
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