，对君权根本就无节制的作用，事无大小，内阁都要秉承皇帝的旨意行事，遂成为皇帝加强独裁的工具，使明代的君主比历代为甚，助长了君主。
形成了明代宦官的专权明代内阁因为欠缺法定的地位和权力，只是政务的补助机关，透过票拟、条旨来辅政，但大学士的票拟最后决定于皇帝的朱批，而明制以司礼监秉笔太监掌章奏文书。
宣宗时，大臣章奏除由皇帝亲批数本外，皆由秉笔太监照内阁大学士之票拟批红。
宣宗以后，人主怠荒，深居内宫，朱批便由秉笔太监处理，从此宦官透过司礼监的职务得以正式与外廷往来，宰辅之权便为内臣所侵夺，司礼监有太上内阁之称，造成了明代宦官的专横。
首辅有持相权而名不正的弊端内阁仅属秘书机关，无宰相之名，也无宰相之位，更无宰相之责，但皇帝信任时，又确有宰相之权利。
明代内阁成立后不久，事实的演变，产生首辅，权利堪比中国古代宰相。
但此不过内阁中相沿的惯例，并非律定，故不为外廷所承认。
《明史纪事本末》说：“严嵩无宰相之名，而有宰相之权；有宰相之权，而无宰相之责。”正是说出了内阁制度的弊端。
内阁有相权而无宰相之责，出错时便诿过他人，无宰相之名位而有宰相之权，则朝臣不能信服。
张居正任首辅，仍须与中官冯保结合才能执掌大权，方能施展抱负，就是很明显的例子。
明代宦官之祸严重，内阁制度之名不正，有着密切的关系。
逐渐演变成朋党的倾轧的摇篮内阁行使相权实在名不正言不顺，容易造成内阁与外廷官僚的磨擦。
所以，魏忠贤有事没事，遇到事情就爱推诿，推到内阁和出事的衙门之间，让内阁和衙门自己协商解决，根本不让事情捅到司礼监这一层面来，这才是最厉害的，会弄的出事衙门和内阁都没辙。
“魏公公，我们现在就写本子弹劾韦宝，陛下什么时候能批复？你们司礼监什么时候能批复、”杨涟问道：“不上朝，奏本总不能不批吧？”
“这咱家可不能给你准信！
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